中國新聞網(wǎng)3月5日?qǐng)?bào)道 4日出版的國際頂尖科學(xué)期刊《自然》,以封面故事介紹由中國深圳華大基因研究院主要承擔(dān)的“人體腸道菌群元基因組參考基因集的構(gòu)建工作”。
該研究屬于歐盟第七框架資助項(xiàng)目——人體腸道元基因組研究計(jì)劃(MetaHIT)的一部分,得到了國家科技部國際合作司和深圳市的配套支持。
深圳華大基因研究院今天表示,作為唯一的非歐盟研究團(tuán)體參與到MetaHIT計(jì)劃中,該院采用高通量的測序技術(shù)和高效能的信息分析平臺(tái),取得了一系列突破性的研究成果。
人體除受自身基因的調(diào)控外,還受到大量的共生細(xì)菌的影響。這些細(xì)菌大部分寄生在人的腸道中,通稱為腸道菌群,在學(xué)術(shù)界常被稱作“人體腸道元基因組”。該項(xiàng)研究成果收集了124個(gè)來自于歐洲人腸道菌群的樣本,采用了新一代大規(guī)模高通量的測序技術(shù)進(jìn)行深度測序,產(chǎn)出近6千億的堿基序列。經(jīng)過序列組裝和基因注釋分析,從中獲得330萬個(gè)非冗余的人體腸道元基因組的參考基因,約是人自身基因的150倍。這個(gè)基因集中包含了絕大部分目前已知的人體腸道微生物基因,但更多的是目前未知微生物的基因。從這個(gè)基因集中可以估計(jì)人腸道中存在約1000到1150種細(xì)菌,平均每個(gè)體內(nèi)約含有160種優(yōu)勢(shì)菌種,并且這些細(xì)菌是絕大部分個(gè)體所共有的。
科學(xué)家近10年來通過在腸道元基因組領(lǐng)域的研究證實(shí),不當(dāng)?shù)娘嬍硶?huì)導(dǎo)致腸道菌群的結(jié)構(gòu)失衡,進(jìn)而引發(fā)的慢性炎癥是造成這些代謝性疾病的主要因素。但具體是哪些菌群的結(jié)構(gòu)失衡,以及它們?nèi)绾我l(fā)慢性炎癥,對(duì)這些問題的回答現(xiàn)在仍處于猜測階段。人體腸道元基因組參考基因集的構(gòu)建,加深了人們對(duì)腸道微生物與人體自身健康關(guān)系的理解。(鄭小紅)
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